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理解 CN 数值:评估抗生素耐药性的关键

简介 CN 值(拷贝数变异)是在细菌基因组中特定基因或区域的拷贝数发生变异。这些变异通常是由于基因组重新排列或水平基因转移引起的。CN 值测试是检测抗生素耐药性的一种重要方法,因为它可以揭示细菌基因组中编码耐药性机制的基因的拷贝数。

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CN 值测试原理 CN 值测试通过比较目标基因与参照基因的拷贝数来确定特定的基因的拷贝数。参照基因通常是存在于细菌基因组中多个拷贝的管家基因。通过扩增目标基因和参照基因的序列,并使用定量实时 PCR 来测量每个基因扩增产物的量,可以确定目标基因与参照基因之间的拷贝数比率。

CN 值与抗生素耐药性 CN 值的升高通常与抗生素耐药性的增加有关。当编码抗生素耐药性机制的基因的拷贝数增加时,它导致更多耐药蛋白的产生,从而降低抗生素治疗的有效性。例如,β-内酰胺酶基因的 CN 值的升高与针对革兰阴性菌的 β-内酰胺类抗生素耐药性的增加有关。

CN 值测试的应用 CN 值测试被广泛用于以下应用:

监测抗生素耐药性的传播 确定抗生素耐药性的遗传基础 预测感染结果

CN 值测试的优点 提供对抗生素耐药性的定量评估 快速且高度灵敏 可以用于各种细菌物种 有助于指导抗生素治疗决策

CN 值测试的局限性 可能受到样品中 DNA 降解或污染的影响 不能检测所有类型的抗生素耐药机制 需要专门的设备和技术人员

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